Les recherches de Marie-Hélène portent sur l’analyse et la modélisation des changements de la biodiversité forestière après perturbations à l’échelle du Québec méridional. Elle travaille aussi sur l'aménagement des espaces verts et la dynamique des communautés végétales en milieu urbain. Elle possède ainsi une expertise en écologie des communautés, en statistiques et en modélisation.